截至目前，我院共有土地资源总面积95412平方米（约143亩），办公、科研及配套用房等总建筑面积约56542平方米。我院已初步形成麦子店院区、双桥院区、杨镇基地、永清基地、昌平基地、苏家屯基地的“两主四辅”空间布局。基本形成了科技创新、中试转化、成果示范、技术培训一体化布局。 

　　本部院区：位于北京市朝阳区麦子店街41号，占地面积约2560平方米，建筑面积约10316平方米，是院本部所在地，是我院集理论研究，政府服务，规划咨询为主要功能的科研智库和智慧中枢。 

　　双桥院区：位于北京市朝阳区双桥中路11号，占地面积约8077平方米，院区现有总建筑面积约15454平方米，建有农业农村部遥感应用中心和生物质工程中心，以及农业农村部农业资源循环利用技术与模式综合实验室、农业废弃物能源化利用重点实验室、耕地利用遥感重点实验室等3个部级重点实验室，是我院农业遥感、生物质工程以及资源循环利用科技创新中心。 

　　顺义杨镇基地：位于北京市顺义区杨镇杨吉路12号，占地面祝约26997平方米，建有农业农村部农产品产后处理综合实验室、农业设施结构工程重点实验室等2个部级重点实验室，以及5000多平方米中试转化车间，农产品加工综合实验楼，是我院中试转化基地和农产品加工工程科技创新中心。 

　　河北永清基地：位于河北永清县龙虎庄乡，占地面积约26667平方米，现有建筑面积6952平方米，建有设施农业试验科研楼和5000多平方米实验温室，是我院设施农业技术研发和成果示范基地。 

　　沈阳苏家屯实验站：位于辽宁省沈阳市苏家屯区大沟乡，占地面积14152平方米，租用农业用地面积约147亩。正在谋划建设农产品仓储物流研究中心，实现科技成果转化与展示。 

　　中国农村能源与环保研究培训中心：位于北京市昌平区东关街道亢山路，占地面积约16958平方米，总建筑面积约12742平方米，是我院农村能源与环保技术研究、技术培训和国际交流中心。